Habe keinen Tipp, aber so würde ich vorgehen:
Schauen wir mal, welche Vorgaben wir haben:
1. "gutes Hotel" => nach Sternen schauen
2. Preis => offenbar egal
3. Lage Nähe Naturkundemuseum => Google Maps nehmen und schauen, welche Hotels dort in der Nähe sind, ggf. mit 1. abgleichen.
4. Nähe zu Tegel bzw. Shuttledienst: Entweder bei 3. mit einbauen oder auf Homepage des Hotels schauen. Ggf. Taxi bzw. öffentliche Verkehrsmittel?
[small]Ansonsten würde ich an deiner Stelle mal bei ebay reinschauen, da bist du ja eigentlich Experte[/small] 
Mir hat das Ramada Hotel gut gefallen.
Direkt am Brandenburger Tor ist das Adlon. 
BTW: Das ist doch eigentlich Rille, in B Tageskarte ÖPNV gekauft und mit S-Bahn und U-Bahn kommst du überall schnell und problemlos hin.
Gruß Kai
Wenn du schon das Steigenberger erwähnst, warum nicht das am Kanzleramt?
Zentral und gut erreichbar sind auch das Mandala Hotel (in der Nähe des Potsdamer Platzes) oder das Sofitel Gendarmenmarkt.
Sehenswürdigkeiten gibt es viele in Berlin und die Interessen sind recht verschieden
Alle drei genannten Hotels haben übrigens einen Shuttledienst...
Und wenn es das Adlon dann doch nicht sein soll, vielleicht das Winters Hotel am Check Point Charlie (Zimmerstr.). Immer noch alles gut fußläufig erreichbar.
Ich könnte folgende Hotels empfehlen:
- Hyatt: am Potsamer Platz - gute Lage
- Ritz Carlton - ebenfalls beim Potsdamer Platz
- Westin Grand - ist an der Friedrichstraße und man kann alles im Zentrum gut erreichen bzw. auch gute Bus bzw. U-Bahn-Anbindung
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