Du kannst max. 4 Partitionen haben, eine davon darf eine erweiterte Partition sein, die man wiederum beliebig unterteilen kann. Das Problem in deinem Fall ist, dass du moeglicherweise die Recovery-Option riskierst.
Ich wuerde mir eine Kopie der kompletten Platte machen (mit dd), dann die 3. und 4. Partition loeschen und dann Ubuntu wie gewohnt installieren (und dabei die 2. Partition ggf. verkleinern). Wenn du Wiederherstellen musst, spielst du das Plattenbackup zurueck und startest den Recovery-Mechanismius.