Kommt drauf an wie alt die Platten sind!
Ich hab auch drei HDDs im PC und die sind ebenso mit etwas mehr als 150GB belegt und da braucht Antivir ca. 45min zum Scannen.
Defragmentierst Du denn?
Wie lange läuft Windows schon drauf ohne, dass mal formatiert wurde?
Hast Du mal einen Speedtest gemacht?
Lad Dir mal HDTach runter und teste mal die Datenübertragungsraten.
Chris